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苏晓泉,博士,教授,博士生导师。泰山学者青年专家,山东省青创人才引育团队带头人,青岛大学特聘教授民盟盟员。研究方向为生物信息学与大数据科学,已在该领域内mBiomSystemsBioinformatics等高水平期刊发表学术论文50余篇,主持国家自然科学基金面上/青年项目、国家重点研发计划任务、山东省自然基金重大基础项目、中科院重点部署项目子课题等,相关成果获得9项软件著作权。担任iMetaMedicine in Microecology等期刊编委。

研究方向

生物信息学,算法设计,高性能计算,数据挖掘

教育背景

2015-2019 中国科学院大学 微生物学生物信息 博士

2010-2011 纽约州立大学石溪分校 (SUNY Stony Brook) 计算机科学 硕士

2005-2009 武汉大学 计算机科学与技术 学士

 

工作经历

2020- 青岛大学 BETVLCTOR伟德官网下载,教授,博导,特聘教授

2017-2020 中国科学院 青岛生物能源与过程研究所 副研究员,硕导

2016 加州大学圣迭戈分校 (UC San Diego) 国家公派访问学者

2014 香港城市大学(City University of Hong Kong) 高级研究助理

2011-2016 中国科学院 青岛生物能源与过程研究所 助理研究员

 

科研项目

  1. 国家重点研发计划 科学数据自主应用软件研发,2022-2025,任务负责人

  2. 山东省青创人才引育计划,2022-2025,团队带头人

  3. 国家自然科学基金 面上项目2021-2024,项目负责人

  4. 国家自然科学基金 国家重大科研仪器研制项目2019-2023,任务负责人

  5. 国家自然科学基金 面上项目,2018-2022, 项目负责人

  6. 山东省自然科学基金 重大基础研究项目, 2017-2019,项目负责人

  7. 中国科学院重点部署项目2017-2019子课题负责人

  8. 国家自然科学基金 青年项目2014-2016,项目负责人

 

近期论文

  1. Chen, Li, et al., Parallel-Meta Suite: interactive and rapid microbiome data analysis on multiple platforms. iMeta 2022. (通讯)

  2. Sun, Liu, et al, Comprehensive understanding to the public health risk of environmental microbes via a microbiome-based index. J. Genet. Genomics 2022. (通讯)

  3. Jing, Zhang, et al., A Scale-Free, Fully Connected Global Transition Network Underlies Known Microbiome Diversity. mSystems 2021. (通讯)

  4. Su*, et al., Elucidating the Beta-Diversity of the Microbiome: from Global Alignment to Local Alignment. mSystems 2021. (一作&通讯)

  5. Jing, Liu, et al. Microbiome Search Engine 2: a Platform for Taxonomic and Functional Search of Global Microbiomes on the Whole-Microbiome Level. mSystems 2021. (通讯)

  6. Wu, Chen, et al., Towards multi-label classification: Next step of machine learning for microbiome research. Comput. Struct. Biotech. J. 2021. (通讯)

  7. Jing, et al. Meta-Apo improves accuracy of 16Samplicon-based prediction of microbiome function. BMC Genomics 2021. (通讯)

  8. Su*, et al., Method development for cross-study microbiome data mining: Challenges and opportunities. Comput. Struct. Biotech. J. 2020. (一作&通讯)

  9. Jing, Zhang, et al. Dynamic Meta-Storms enables comprehensive taxonomic and phylogenetic comparison of shotgun metagenomes at the species level. Bioinformatics 2020. (通讯)

  10. Su*, et al. Multiple disease detection and classification across cohorts via microbiome search. mSystems 2020. (一作&通讯)

  11. Su*, et al. Reply to Sun et al., “Identifying composition novelty in microbiome studies: Improvement of prediction accuracy”. mBio 2019. (一作&通讯)

  12. Su*, et al., Identifying and predicting novelty in microbiome studies. mBio 2018. (一作&通讯)

 

知识产权

  1. 软件著作权:Parallel-Meta Suite,登记号:2022SR0929246

  2. 软件著作权:微生物组功能分层比对系统,登记号:2021SR0952303

  3. 软件著作权:微生物组功能校正系统,登记号:2020SR0346691

  4. 软件著作权:宏基因组动态比对系统,登记号:2020SR0341268

  5. 软件著作权:微生物组数据库索引与搜索系统2.0, 登记号:2018SR279078

  6. 软件著作权:元基因组数据分析系统,登记号:2016SR053280

  7. 软件著作权:基因组数据库索引与搜索系统, 登记号:2013SR000258

  8. 软件著作权:并行化高通量测序数据质量控制软件1.0,登记号:2013SR080803

  9. 软件著作权:基于GPGPU和多核心CPU硬件的元基因组数据分析软件2.0,登记号: 2012SR055051

     

    联系方式

    Email: suxq@qdu.edu.cn

 

 

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